Cuando se produce un error en la factura, debe emitirse una factura rectificativa que debe cumplir una serie de requisitos: indicar el tipo de factura rectificativa (sustitutiva o por diferencias); el motivo, mediante el código correspondiente; y dentro de una serie de facturación específica para las facturas rectificativas.

A la hora de elegir el tipo de factura rectificativa, no existe ninguna condición que obligue a usar un tipo u otro; queda completamente a elección del emisor pero dependiendo del motivo de la rectificación, conviene más un tipo que otro y conlleva un procedimiento diferente a la hora de tramitarla:  
  • Factura rectificativa sustitutiva se utiliza especialmente para corregir errores relacionados con datos que no afectan la base imponible o el importe de la factura: errores en el NIF, dirección o en la descripción del concepto, por ejemplo.  
  • Factura rectificativas por diferencias se utiliza sobretodo para modificar los datos económicos y fiscales de la factura original, complementando los de la factura inicial: error en la cantidad o en el importe facturado.

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